个人简介：
宣佳佳，博士，硕士研究生导师，暨南大学青年拔尖人才（“青蓝学者”）。长期致力于RNA修饰的鉴定和功能研究。RNA修饰参与调控生物体内的许多分子过程和细胞过程，并且在疾病和癌症的发生发展中扮演着重要的作用，但绝大多数RNA修饰的功能与机制仍有待阐明。因此，开发了相应的计算机分析方法并结合多种实验方法，联合分析了数千个RNA-seq、CLIP-seq和ChIP-seq高通量测序数据，对RNA修饰及其发生机制和生物学功能进行了系统的预测和分析，为62个物种构建了目前国际上最全面的RNA修饰图谱，分别从转录组和基因组层面研究了RNA修饰的动态形成机制，创新性地在mRNA分子中鉴定到由snoRNA指导发生的Ψ修饰和2’-O-Me修饰，并鉴定了多个与m6A修饰和m5C修饰显著相关的组蛋白修饰，鉴定了多个新的m6A结合蛋白和m5C结合蛋白，并系统地解析了RNA修饰蛋白在癌症中的表达谱和变异图谱，鉴定了4个调控结直肠癌细胞增殖的RNA修饰蛋白和一批癌症驱动RNA修饰蛋白。最终构建了RMBase数据库和RNAEpiHub分析平台，以可视化的方式展示了RNA修饰相关的所有结果，并提供了可视化的自定义分析工具，是目前国际上最全面的RNA修饰数据库和分析平台。在国际期刊上发表多篇SCI论文，其中一篇引用超过220次。
具有丰富的转录组（RNA-seq）、RNA结合蛋白靶标组（CLIP-seq）、翻译组（Ribo-seq）等数据挖掘经验及算法开发经验，在表观遗传修饰、非编码RNA表达和调控网络及RNA-RNA结合蛋白互作网络等方面做出一系列创新性成果，成功开发了RMBase、Pol3Base、deepBase、ChIPBase和starBase平台，参与解析了TP53诱导的lncRNA编码功能性多肽的机制及其抑制细胞增殖的功能。
研究方向：
① RNA表观遗传修饰；
② 非编码RNA的表达和调控网络；
③ 基于生物信息学方法研究癌症的发生发展机制
学习经历：
2022年：中山大学博士学位，中山大学博士研究生优秀毕业生
2018年：中山大学硕士学位
工作经历：
2022年-至今：暨南大学生命科学技术学院，助理研究员
荣誉奖励
暨南大学青年拔尖人才（“青蓝学者”）
中山大学博士研究生优秀毕业生
主要论文：
1. Xuan J, Chen L, Chen Z, Pang J, Huang J, Lin J, Zheng L, Li B, Qu L, Yang J. RMBase v3.0: decode the landscape, mechanisms and functions of RNA modifications. Nucleic Acids Res. 2024 Jan 5;52(D1):D273-D284. doi: 10.1093/nar/gkad1070.
2. Xuan JJ, Sun WJ, Lin PH, Zhou KR, Liu S, Zheng LL, Qu LH, Yang JH. RMBase v2.0: deciphering the map of RNA modifications from epitranscriptome sequencing data. Nucleic Acids Res. 2018 Jan 4;46(D1):D327-D334. doi: 10.1093/nar/gkx934.
3. Cai L, Xuan J, Lin Q, Wang J, Liu S, Xie F, Zheng L, Li B, Qu L, Yang J. Pol3Base: a resource for decoding the interactome, expression, evolution, epitranscriptome and disease variations of Pol III-transcribed ncRNAs. Nucleic Acids Res. 2022 Jan 7;50(D1):D279-D286. doi: 10.1093/nar/gkab1033.
4. Xie F, Liu S, Wang J, Xuan J, Zhang X, Qu L, Zheng L, Yang J. deepBase v3.0: expression atlas and interactive analysis of ncRNAs from thousands of deep-sequencing data. Nucleic Acids Res. 2021 Jan 8;49(D1):D877-D883. doi: 10.1093/nar/gkaa1039.
5. Huang J, Zheng W, Zhang P, Lin Q, Chen Z, Xuan J, Liu C, Wu D, Huang Q, Zheng L, Liu S, Zhou K, Qu L, Li B, Yang J. ChIPBase v3.0: the encyclopedia of transcriptional regulations of non-coding RNAs and protein-coding genes. Nucleic Acids Res. 2023 Jan 6;51(D1):D46-D56. doi: 10.1093/nar/gkac1067.
6. Xu W, Liu C, Deng B, Lin P, Sun Z, Liu A, Xuan J, Li Y, Zhou K, Zhang X, Huang Q, Zhou H, He Q, Li B, Qu L, Yang J. TP53-inducible putative long noncoding RNAs encode functional polypeptides that suppress cell proliferation. Genome Res. 2022 Jun;32(6):1026-1041. doi: 10.1101/gr.275831.121. Epub 2022 May 24.
承担课题：
① RNA修饰蛋白图谱的构建及其在人类癌症中的驱动作用，2023/1—2024/12，主持。
② 基于高通量测序数据开发标准化算法用于精确鉴定和定量RNA修饰并解析它们的空间特异性和时间特异性，2024/1-2025/12，主持
讲授课程：
① 功能蛋白研究（研究生）
② 生物信息学（研究生）
③ 基因组学（本科生）
④ 生物化学与分子生物学（本科生）
电子邮箱：xuanjj@jnu.edu.cn
办公地址：暨南大学石牌校区第二理工楼902B
